ユーザマスタで権限を設定すると、集計の対象範囲が全社員となります。
特定の部署に所属するメンバーのみ集計を閲覧できるようにしたい場合は、管理グループ管理で「部署権限」をご設定ください。
なお、全社権限と部署権限で同じ権限が付与されている場合、全社権限が優先されますので、全社権限で一般権限以外の権限が付与されている場合は、全社権限を一般権限に変更し、部署権限をご設定ください。
参考
個別データ管理:管理グループ情報(08-01.個別データ管理:管理グループ情報を新規登録する)
複数データ一括管理(09-08.複数データ一括管理:管理グループマスタを作成する)